La saison 1999-2000 du Championnat du Mozambique de football est la vingt-quatrième édition du championnat de première division au Mozambique. Après un tour préliminaire régional de qualification, les douze meilleurs clubs du pays sont regroupés au sein d'une poule unique où ils s'affrontent deux fois, à domicile et à l'extérieur. En fin de saison, les trois derniers sont relégués et remplacés par les trois meilleurs clubs de deuxième division.
C'est le CD Costa do Sol qui remporte le championnat cette saison après avoir terminé en tête du classement final, avec quatre points d'avance sur le tenant du titre, le Clube Ferroviario de Maputo et treize sur le CD Matchedje. C'est le septième titre de champion du Mozambique de l'histoire du club, qui réussit même le doublé en s'imposant en finale de la Coupe du Mozambique face au CD Matchedje.
Vingt-cinq clubs sont répartis en six poules et affrontent une seule fois chacun de leurs adversaires. Seul le premier de chaque groupe se qualifie pour la poule finale.
Le championnat porte le nom de Moçambola depuis sa création en 1976. Les saisons en noir sont celles dont on ne connaît que le champion de façon certaine (voir le palmarès).
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Championnats nationaux de première division 1999-2000 à travers le monde