Microphthalmia-associated transcription factor

MITF
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

4C7N

Identifiants
AliasesMITF
IDs externesOMIM: 156845 MGI: 104554 HomoloGene: 4892 GeneCards: MITF
Position du gène (Homme)
Chromosome 3 humain
Chr.Chromosome 3 humain[1]
Chromosome 3 humain
Localisation génomique pour MITF
Localisation génomique pour MITF
Locus3p13Début69,739,456 bp[1]
Fin69,968,336 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour MITF
Localisation génomique pour MITF
Locus6 D3|6 45.05 cMDébut97,784,013 bp[2]
Fin97,998,310 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • épithélium pigmentaire rétinien

  • Skeletal muscle tissue of biceps brachii

  • ventricule droit

  • muscle glutéal

  • myocarde

  • Skeletal muscle tissue of rectus abdominis

  • muscle vaste latéral

  • myocardium of left ventricle

  • muscle deltoïde

  • urètre
Fortement exprimé dans
  • glande pinéale

  • gastrula

  • Caduque basale

  • iris

  • corps ciliaire

  • Epithelium of choroid plexus

  • épithélium pigmentaire rétinien

  • strie vasculaire

  • ventricule droit

  • valve auriculo-ventriculaire
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • protein dimerization activity
  • DNA-binding transcription factor activity
  • liaison protéique
  • DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • liaison de chromatine
  • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
  • E-box binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • nucléoplasme
  • noyau
  • complexe macromoléculaire
Processus biologique
  • regulation of RNA biosynthetic process
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of DNA-templated transcription, initiation
  • transcription, DNA-templated
  • développent d'un organisme multicellulaire
  • positive regulation of gene expression
  • transcription by RNA polymerase II
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • régulation de l'expression des gènes
  • Voie de signalisation Wnt
  • différenciation cellulaire
  • osteoclast differentiation
  • melanocyte differentiation
  • regulation of cell population proliferation
  • camera-type eye development
  • negative regulation of apoptotic process
  • pigmentation
  • canonical Wnt signaling pathway involved in negative regulation of apoptotic process
  • cell fate commitment
  • regulation of osteoclast differentiation
  • régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • remodelage osseux
  • protein-containing complex assembly
  • negative regulation of cell migration
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

4286

17342

Ensembl

ENSG00000187098

ENSMUSG00000035158

UniProt

O75030

Q08874

RefSeq (mRNA)
NM_000248
NM_001184967
NM_001184968
NM_006722
NM_198158

NM_198159
NM_198177
NM_198178
NM_001354604
NM_001354605
NM_001354606
NM_001354607
NM_001354608

NM_001113198
NM_001178049
NM_008601

RefSeq (protéine)
NP_000239
NP_001171896
NP_001171897
NP_006713
NP_937801

NP_937802
NP_937820
NP_937821
NP_001341533
NP_001341534
NP_001341535
NP_001341536
NP_001341537

NP_001106669
NP_001171520
NP_032627

Localisation (UCSC)Chr 3: 69.74 – 69.97 MbChr 6: 97.78 – 98 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le facteur de transcription associé à la microphtalmie (en anglais, Microphtalmia-associated Transcription Factor abrégé en MITF) est un facteur de transcription en hélice-boucle-hélice impliqué dans le développement mélanocytaire et la survie de ces cellules[5],[6]. Son gène, MITF, est situé sur le chromosome 3 humain.

Il pourrait réguler le gène IRF4 dans les mélanocytes[7].

En médecine

Une mutation du gène entraînant une perte de fonction de la protéine provoque un syndrome de Waardenburg de type 2A. D'autres mutations de ce gène est retrouvé dans certains cas de mélanome malin[8].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187098 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000035158 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Moore et al., 1995
  6. Fisher et al., 2000
  7. (en-GB) K. S. Hoek, N. C. Schlegel, O. M. Eichhoff, D. S. Widmer, C. Praetorius, S. O. Einarsson, S. Valgeirsdottir, K. Bergsteinsdottir, A. Schepsky, R. Dummer et E. Steingrimsson, « Novel MITF targets identified using a two-step DNA microarray strategy », Pigment Cell Melanoma Res., vol. 21, no 6,‎ , p. 665–76 (PMID 19067971, DOI 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x)
  8. Kawakami A, Fisher DE, The master role of microphthalmia-associated transcription factor in melanocyte and melanoma biology, Lab Invest, 2017;97:649-656

Voir aussi

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