A H3 hisztonfehérje egy az 5, eukarióta sejtek kromatin szerveződésének kialakításában részt vevő hiszton fehérje közül. Rendelkezik egy fő globuláris doménnel és hosszú N terminális véggel. A H3 hiszton részt vesz az ún. 'beads on a string' szerkezet létrehozásában.