STAT6

STAT6
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1OJ5, 4Y5W, 4Y5U

Идентификаторы
ПсевдонимыSTAT6, D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, signal transducer and activator of transcription 6
Внешние IDOMIM: 601512 MGI: 103034 HomoloGene: 2373 GeneCards: STAT6
Расположение гена (человек)
12-я хромосома человека
Хр.12-я хромосома человека[1]
12-я хромосома человека
Расположение в геноме STAT6
Расположение в геноме STAT6
Локус12q13.3Начало57,095,408 bp[1]
Конец57,132,139 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
10-я хромосома мыши
Хр.10-я хромосома мыши[2]
10-я хромосома мыши
Расположение в геноме STAT6
Расположение в геноме STAT6
Локус10 D3|10 74.59 cMНачало127,478,855 bp[2]
Конец127,496,826 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right adrenal cortex

  • right uterine tube

  • left uterine tube

  • body of uterus
Наибольшая экспрессия в
  • lumbar spinal ganglion

  • stroma of bone marrow
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание похожих белков
  • sequence-specific DNA binding
  • protein phosphatase binding
  • ДНК-связывающий
  • связывание с белками плазмы
  • DNA-binding transcription factor activity
  • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Компонент клетки
  • клеточное ядро
  • нуклеоплазма
  • липидный рафт
  • цитоплазма
  • цитозоль
  • ядерная мембрана
Биологический процесс
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • T-helper 1 cell lineage commitment
  • regulation of cell population proliferation
  • response to cytokine
  • interleukin-4-mediated signaling pathway
  • ДНК-зависимая регуляция транскрипции
  • cellular response to hydrogen peroxide
  • mammary gland epithelial cell proliferation
  • cellular response to reactive nitrogen species
  • positive regulation of type I interferon production
  • positive regulation of isotype switching to IgE isotypes
  • mammary gland morphogenesis
  • negative regulation of type 2 immune response
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • передача сигнала
  • транскрипция, ДНК-зависимая
  • положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
  • transcription by RNA polymerase II
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • positive regulation of cold-induced thermogenesis
  • defense response
  • receptor signaling pathway via JAK-STAT
  • response to peptide hormone
  • growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

6778

20852

Ensembl

ENSG00000166888

ENSMUSG00000002147

UniProt

P42226

P52633

RefSeq (мРНК)

NM_001178078
NM_001178079
NM_001178080
NM_001178081
NM_003153

NM_009284

RefSeq (белок)

NP_001171549
NP_001171550
NP_001171551
NP_001171552
NP_003144

NP_033310

Локус (UCSC)Chr 12: 57.1 – 57.13 MbChr 10: 127.48 – 127.5 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Сигнальный белок и активатор транскрипции 6 (STAT6) – это человеческий ген. Белок , кодируемый этим геном, является членом транскрипционных факторов семейства STAT.[5][6]

В ответ на цитокины и факторы роста члены семейства STAT фосфорилируются рецептор-ассоциированными киназами, а затем образуют гомо- или гетеродимеры, которые транслоцируются в ядро клетки, где они действуют как активаторы транскрипции. Этот белок играет центральную роль в осуществлении ИЛ4 опосредованных биологических реакций. Установлено, что он индуцирует экспрессию BCL2L1/BCL-X(L), которая отвечает за антиапоптотическую активность ИЛ4. Исследования нокаута на мышах показали роль этого гена в дифференцировке Т-хелпера 2 (Th2), экспрессии маркеров клеточной поверхности и переключении класса иммуноглобулинов.[7]

Взаимодействия

Было показано, что STAT6 взаимодействует с:

Патология

  • Слияние генов
    • Рецидивирующие соматические слияния двух генов, NGFI-A-связывающего белка 2 (NAB2) and STAT6, located at chromosomal region 12q13, асположенных в хромосомной области 12q13, были идентифицированы в одиночных фиброзных опухолях.[14]
  • Амплификация
    • STAT6 амплифицируется в подмножестве дедифференцированных липосарком.[15]

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000166888 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000002147 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Leek JP, Hamlin PJ, Bell SM, Lench NJ (1997). "Assignment of the STAT6 gene (STAT6) to human chromosome band 12q13 by in situ hybridization". Cytogenetics and Cell Genetics. 79 (3—4): 208—9. doi:10.1159/000134723. PMID 9605853.
  6. ↑ Hou J, Schindler U, Henzel WJ, Ho TC, Brasseur M, McKnight SL (Sep 1994). "An interleukin-4-induced transcription factor: IL-4 Stat". Science. 265 (5179): 1701—6. Bibcode:1994Sci...265.1701H. doi:10.1126/science.8085155. PMID 8085155.
  7. ↑ Entrez Gene: STAT6 signal transducer and activator of transcription 6, interleukin-4 induced  (неопр.).
  8. ↑ 1 2 McDonald C, Reich NC (Jul 1999). "Cooperation of the transcriptional coactivators CBP and p300 with Stat6". Journal of Interferon & Cytokine Research. 19 (7): 711—22. doi:10.1089/107999099313550. PMID 10454341.
  9. ↑ 1 2 Litterst CM, Pfitzner E (Dec 2001). "Transcriptional activation by STAT6 requires the direct interaction with NCoA-1". The Journal of Biological Chemistry. 276 (49): 45713—21. doi:10.1074/jbc.M108132200. PMID 11574547.
  10. ↑ Gupta S, Jiang M, Anthony A, Pernis AB (Dec 1999). "Lineage-specific modulation of interleukin 4 signaling by interferon regulatory factor 4". The Journal of Experimental Medicine. 190 (12): 1837—48. doi:10.1084/jem.190.12.1837. PMC 2195723. PMID 10601358.
  11. ↑ Shen CH, Stavnezer J (Jun 1998). "Interaction of stat6 and NF-kappaB: direct association and synergistic activation of interleukin-4-induced transcription". Molecular and Cellular Biology. 18 (6): 3395—404. doi:10.1128/mcb.18.6.3395. PMC 108921. PMID 9584180.
  12. ↑ Litterst CM, Pfitzner E (Sep 2002). "An LXXLL motif in the transactivation domain of STAT6 mediates recruitment of NCoA-1/SRC-1". The Journal of Biological Chemistry. 277 (39): 36052—60. doi:10.1074/jbc.M203556200. PMID 12138096.
  13. ↑ Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (Sep 2002). "Identification of p100 as a coactivator for STAT6 that bridges STAT6 with RNA polymerase II". The EMBO Journal. 21 (18): 4950—8. doi:10.1093/emboj/cdf463. PMC 126276. PMID 12234934.
  14. ↑ Kabbinavar FF, Hambleton J, Mass RD, Hurwitz HI, Bergsland E, Sarkar S (Jun 2005). "Combined analysis of efficacy: the addition of bevacizumab to fluorouracil/leucovorin improves survival for patients with metastatic colorectal cancer". Journal of Clinical Oncology. 23 (16): 3706—12. doi:10.1200/JCO.2005.00.232. PMID 15867200.
  15. ↑ Doyle LA, Tao D, Mariño-Enríquez A (Sep 2014). "STAT6 is amplified in a subset of dedifferentiated liposarcoma". Modern Pathology. 27 (9): 1231—7. doi:10.1038/modpathol.2013.247. PMID 24457460.

См. также

Интерлейкин 4

Литература

  • Jiang H, Harris MB, Rothman P (Jun 2000). "IL-4/IL-13 signaling beyond JAK/STAT". The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 105 (6 Pt 1): 1063—70. doi:10.1067/mai.2000.107604. PMID 10856136.
  • Kisseleva T, Bhattacharya S, Braunstein J, Schindler CW (Feb 2002). "Signaling through the JAK/STAT pathway, recent advances and future challenges". Gene. 285 (1—2): 1—24. doi:10.1016/S0378-1119(02)00398-0. PMID 12039028.
  • Hou J, Schindler U, Henzel WJ, Ho TC, Brasseur M, McKnight SL (Sep 1994). "An interleukin-4-induced transcription factor: IL-4 Stat". Science. 265 (5179): 1701—6. Bibcode:1994Sci...265.1701H. doi:10.1126/science.8085155. PMID 8085155.
  • Takeda K, Tanaka T, Shi W, Matsumoto M, Minami M, Kashiwamura S, Nakanishi K, Yoshida N, Kishimoto T, Akira S (Apr 1996). "Essential role of Stat6 in IL-4 signalling". Nature. 380 (6575): 627—30. Bibcode:1996Natur.380..627T. doi:10.1038/380627a0. PMID 8602263.
  • Shimoda K, van Deursen J, Sangster MY, Sarawar SR, Carson RT, Tripp RA, Chu C, Quelle FW, Nosaka T, Vignali DA, Doherty PC, Grosveld G, Paul WE, Ihle JN (Apr 1996). "Lack of IL-4-induced Th2 response and IgE class switching in mice with disrupted Stat6 gene". Nature. 380 (6575): 630—3. Bibcode:1996Natur.380..630S. doi:10.1038/380630a0. PMID 8602264.
  • Kotanides H, Reich NC (Oct 1996). "Interleukin-4-induced STAT6 recognizes and activates a target site in the promoter of the interleukin-4 receptor gene". The Journal of Biological Chemistry. 271 (41): 25555—61. doi:10.1074/jbc.271.41.25555. PMID 8810328.
  • Mikita T, Campbell D, Wu P, Williamson K, Schindler U (Oct 1996). "Requirements for interleukin-4-induced gene expression and functional characterization of Stat6". Molecular and Cellular Biology. 16 (10): 5811—20. doi:10.1128/mcb.16.10.5811. PMC 231582. PMID 8816495.
  • Shen CH, Stavnezer J (Jun 1998). "Interaction of stat6 and NF-kappaB: direct association and synergistic activation of interleukin-4-induced transcription". Molecular and Cellular Biology. 18 (6): 3395—404. doi:10.1128/mcb.18.6.3395. PMC 108921. PMID 9584180.
  • Leek JP, Hamlin PJ, Bell SM, Lench NJ (1998). "Assignment of the STAT6 gene (STAT6) to human chromosome band 12q13 by in situ hybridization". Cytogenetics and Cell Genetics. 79 (3—4): 208—9. doi:10.1159/000134723. PMID 9605853.
  • Mikita T, Kurama M, Schindler U (Aug 1998). "Synergistic activation of the germline epsilon promoter mediated by Stat6 and C/EBP beta". Journal of Immunology. 161 (4): 1822—8. PMID 9712049.
  • Patel BK, Keck CL, O'Leary RS, Popescu NC, LaRochelle WJ (Sep 1998). "Localization of the human stat6 gene to chromosome 12q13.3-q14.1, a region implicated in multiple solid tumors". Genomics. 52 (2): 192—200. doi:10.1006/geno.1998.5436. PMID 9782085.
  • Zhu M, John S, Berg M, Leonard WJ (Jan 1999). "Functional association of Nmi with Stat5 and Stat1 in IL-2- and IFNgamma-mediated signaling". Cell. 96 (1): 121—30. doi:10.1016/S0092-8674(00)80965-4. PMID 9989503.
  • McDonald C, Reich NC (Jul 1999). "Cooperation of the transcriptional coactivators CBP and p300 with Stat6". Journal of Interferon & Cytokine Research. 19 (7): 711—22. doi:10.1089/107999099313550. PMID 10454341.
  • Harris MB, Chang CC, Berton MT, Danial NN, Zhang J, Kuehner D, Ye BH, Kvatyuk M, Pandolfi PP, Cattoretti G, Dalla-Favera R, Rothman PB (Oct 1999). "Transcriptional repression of Stat6-dependent interleukin-4-induced genes by BCL-6: specific regulation of iepsilon transcription and immunoglobulin E switching". Molecular and Cellular Biology. 19 (10): 7264—75. doi:10.1128/mcb.19.10.7264. PMC 84719. PMID 10490661.
  • Gupta S, Jiang M, Pernis AB (Oct 1999). "IFN-alpha activates Stat6 and leads to the formation of Stat2:Stat6 complexes in B cells". Journal of Immunology. 163 (7): 3834—41. PMID 10490982.
  • Gupta S, Jiang M, Anthony A, Pernis AB (Dec 1999). "Lineage-specific modulation of interleukin 4 signaling by interferon regulatory factor 4". The Journal of Experimental Medicine. 190 (12): 1837—48. doi:10.1084/jem.190.12.1837. PMC 2195723. PMID 10601358.
  • Daniel C, Salvekar A, Schindler U (May 2000). "A gain-of-function mutation in STAT6". The Journal of Biological Chemistry. 275 (19): 14255—9. doi:10.1074/jbc.C000129200. PMID 10747856.
  • Arinobu Y, Sugimoto R, Akaiwa M, Arima K, Otsuka T, Hamasaki N, Izuhara K (Oct 2000). "Augmentation of signal transducer and activation of transcription (STAT)6 and STAT3 expression in stimulated B and T cells". Biochemical and Biophysical Research Communications. 277 (2): 317—24. doi:10.1006/bbrc.2000.3674. PMID 11032724.
  • Masuda A, Matsuguchi T, Yamaki K, Hayakawa T, Yoshikai Y (Jul 2001). "Interleukin-15 prevents mouse mast cell apoptosis through STAT6-mediated Bcl-xL expression". The Journal of Biological Chemistry. 276 (28): 26107—13. doi:10.1074/jbc.M011475200. PMID 11369758.