GC sadržaj

Nukleotidne veze AT i GC parova. Strelice ukazuju na vodonične veze.

U molekularnoj biologiji i genetici, GC-sadržaj (ili guanin-citozinski sadržaj) je udeo azotnih baza u DNK molekulu koje su bilo guanin ili citozin (od moguće četiri baze, gde su preostale dve adenin i timin).[1] Ovaj parameter se može odnositi na specifični fragment DNK ili RNK molekula, ili na ceo genom. U slučaju fragmenta genetičkog materijala, GC-sadržaj se može odnositi na deo gena (domen), ceo gen, grupu gena (ili genski klaster), ili na nekodirajući region. G (guanin) i C (citozin) podležu specifičnom vodoničnom vezivanju. Adenin se specifično vezuje za timin.

Određivanje GC sadržaja

GC sadržaj se obično izražava u procentima, a u nekim slučajevima kao odnos. Procentni GC-sadržaj je[2]

G + C A + T + G + C ×   100 {\displaystyle {\cfrac {G+C}{A+T+G+C}}\times \ 100}

dok je AT/GC odnos[3]

A + T G + C {\displaystyle {\cfrac {A+T}{G+C}}} .

Reference

  1. ↑ Definition of GC – content on CancerWeb of Newcastle University,UK
  2. ↑ Madigan,MT. and Martinko JM. (2003). Brock biology of microorganisms (10th izd.). Pearson-Prentice Hall. ISBN 84-205-3679-2. 
  3. ↑ „Definition of GC-ratio on Northwestern University, IL, USA”. Arhivirano iz originala na datum 2010-06-20. Pristupljeno 2014-05-05. 

Spoljašnje veze

  • Tabela sa GC-sadržajem svih sekvenciranih prokariota
  • Taksonomski brauzer.