C6orf89

Ідентифікатори

Символи

C6orf89, BRAP, chromosome 6 open reading frame 89, PS1TP5TP1

Зовнішні ІД

OMIM: 616642 MGI: 2136782 HomoloGene: 12728 GeneCards: C6orf89

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • ядерце • midbody • мембрана • цитоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of histone deacetylase activity • epithelial cell proliferation • Загоєння ран • positive regulation of cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


221477


80748

Ensembl


ENSG00000198663


ENSMUSG00000052712

UniProt


Q6UWU4


Q99KU6

RefSeq (мРНК)


NM_001286635 NM_001286636 NM_001286637 NM_152734


NM_030561

RefSeq (білок)


NP_001273564 NP_001273565 NP_001273566 NP_689947 NP_001273564.1


NP_085038

Локус (UCSC)

Хр. 6: 36.87 – 36.93 Mb

Хр. 17: 29.27 – 29.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

C6orf89 (англ. Chromosome 6 open reading frame 89) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 39 870^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLAANEISI	YDKLSETVDL	VRQTGHQCGM	SEKAIEKFIR	QLLEKNEPQR
PPPQYPLLIV	VYKVLATLGL	ILLTAYFVIQ	PFSPLAPEPV	LSGAHTWRSL
IHHIRLMSLP	IAKKYMSENK	GVPLHGGDED	RPFPDFDPWW	TNDCEQNESE
PIPANCTGCA	QKHLKVMLLE	DAPRKFERLH	PLVIKTGKPL	LEEEIQHFLC
QYPEATEGFS	EGFFAKWWRC	FPERWFPFPY	PWRRPLNRSQ	MLRELFPVFT
HLPFPKDASL	NKCSFLHPEP	VVGSKMHKMP	DLFIIGSGEA	MLQLIPPFQC
RRHCQSVAMP	IEPGDIGYVD	TTHWKVYVIA	RGVQPLVICD	GTAFSEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, апараті гольджі.

Література

Lalioti V.S., Vergarajauregui S., Villasante A., Pulido D., Sandoval I.V. (2013). C6orf89 encodes three distinct HDAC enhancers that function in the nucleolus, the Golgi and the midbody. J. Cell. Physiol. 228: 1907—1921. PMID 23460338 DOI:10.1002/jcp.24355
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21114 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6UWU4 (англ.) . Архів оригіналу за 26 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.