CYP2B6

CYP2B6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3IBD, 3QOA, 3QU8, 3UA5, 4I91, 4RQL, 4RRT, 4ZV8

Ідентифікатори
Символи CYP2B6, CPB6, CYP2B, CYP2B7, CYP2B7P, CYPIIB6, EFVM, IIB1, P450, cytochrome P450 family 2 subfamily B member 6, Cytochrome P450 2B6
Зовнішні ІД OMIM: 123930 MGI: 88598 HomoloGene: 73894 GeneCards: CYP2B6
Реагує на сполуку
Тиклопідин[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

iron ion binding
arachidonic acid epoxygenase activity
oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
зв'язування з іоном металу
heme binding
GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
oxidoreductase activity
steroid hydroxylase activity
monooxygenase activity

Клітинна компонента

organelle membrane
endoplasmic reticulum membrane
мембрана
внутрішньоклітинна мембранна органела
ендоплазматичний ретикулум
цитоплазма

Біологічний процес

steroid metabolic process
epoxygenase P450 pathway
cellular ketone metabolic process
xenobiotic metabolic process
organic acid metabolic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1555
13088
Ensembl
ENSG00000197408
ENSMUSG00000030483
UniProt
P20813
P12791
RefSeq (мРНК)
NM_000767
NM_009999
RefSeq (білок)
NP_000758
н/д
Локус (UCSC) Хр. 19: 40.99 – 41.02 Mb Хр. 7: 25.6 – 25.63 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CYP2B6 (англ. Cytochrome P450 family 2 subfamily B member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 56 278[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MELSVLLFLALLTGLLLLLVQRHPNTHDRLPPGPRPLPLLGNLLQMDRRG
LLKSFLRFREKYGDVFTVHLGPRPVVMLCGVEAIREALVDKAEAFSGRGK
IAMVDPFFRGYGVIFANGNRWKVLRRFSVTTMRDFGMGKRSVEERIQEEA
QCLIEELRKSKGALMDPTFLFQSITANIICSIVFGKRFHYQDQEFLKMLN
LFYQTFSLISSVFGQLFELFSGFLKYFPGAHRQVYKNLQEINAYIGHSVE
KHRETLDPSAPKDLIDTYLLHMEKEKSNAHSEFSHQNLNLNTLSLFFAGT
ETTSTTLRYGFLLMLKYPHVAERVYREIEQVIGPHRPPELHDRAKMPYTE
AVIYEIQRFSDLLPMGVPHIVTQHTSFRGYIIPKDTEVFLILSTALHDPH
YFEKPDAFNPDHFLDANGALKKTEAFIPFSLGKRICLGEGIARAELFLFF
TTILQNFSMASPVAPEDIDLTPQECGVGKIPPTYQIRFLPR

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом, НАДФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

  • Miles J.S., McLaren A.W., Wolf C.R. (1989). Alternative splicing in the human cytochrome P450IIB6 gene generates a high level of aberrant messages. Nucleic Acids Res. 17: 8241—8255. PMID 2813061 DOI:10.1093/nar/17.20.8241
  • Thum T., Borlak J. (2000). Gene expression in distinct regions of the heart. Lancet. 355: 979—983. PMID 10768437 DOI:10.1016/S0140-6736(00)99016-0
  • Miyazawa M., Shindo M., Shimada T. (2001). Roles of cytochrome P450 3A enzymes in the 2-hydroxylation of 1,4-cineole, a monoterpene cyclic ether, by rat and human liver microsomes. Xenobiotica. 31: 713—723. PMID 11695850 DOI:10.1080/00498250110065595
  • Shah M.B., Pascual J., Zhang Q., Stout C.D., Halpert J.R. (2011). Structures of cytochrome P450 2B6 bound to 4-benzylpyridine and 4-(4-nitrobenzyl)pyridine: insight into inhibitor binding and rearrangement of active site side chains. Mol. Pharmacol. 80: 1047—1055. PMID 21875942 DOI:10.1124/mol.111.074427
  • Carr D.F., la Porte C.J., Pirmohamed M., Owen A., Cortes C.P. (2010). Haplotype structure of CYP2B6 and association with plasma efavirenz concentrations in a Chilean HIV cohort. J. Antimicrob. Chemother. 65: 1889—1893. PMID 20639527 DOI:10.1093/jac/dkq260
  • Ariyoshi N., Miyazaki M., Toide K., Sawamura Y.I., Kamataki T. (2001). A single nucleotide polymorphism of CYP2b6 found in Japanese enhances catalytic activity by autoactivation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281: 1256—1260. PMID 11243870 DOI:10.1006/bbrc.2001.4524

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з cytochrome P450 family 2 subfamily B member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2615 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, P20813 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»