PDLIM2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PA1, 3PDV

Ідентифікатори

Символи

PDLIM2, MYSTIQUE, SLIM, PDZ and LIM domain 2

Зовнішні ІД

OMIM: 609722 MGI: 2384850 HomoloGene: 11006 GeneCards: PDLIM2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • actin binding • muscle alpha-actinin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • stress fiber • Z disc • filamentous actin
Біологічний процес	• heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64236


213019

Ensembl


ENSG00000120913


ENSMUSG00000022090

UniProt


Q96JY6


Q8R1G6

RefSeq (мРНК)


NM_198042 NM_021630 NM_176871 NM_001368120


NM_001253736 NM_145978

RefSeq (білок)


NP_067643 NP_789847 NP_932159 NP_001355049


NP_001240665 NP_666090

Локус (UCSC)

Хр. 8: 22.58 – 22.6 Mb

Хр. 14: 70.4 – 70.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDLIM2 (англ. PDZ and LIM domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 37 459^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALTVDVAGP	APWGFRITGG	RDFHTPIMVT	KVAERGKAKD	ADLRPGDIIV
AINGESAEGM	LHAEAQSKIR	QSPSPLRLQL	DRSQATSPGQ	TNGDSSLEVL
ATRFQGSVRT	YTESQSSLRS	SYSSPTSLSP	RAGSPFSPPP	SSSSLTGEAA
ISRSFQSLAC	SPGLPAADRL	SYSGRPGSRQ	AGLGRAGDSA	VLVLPPSPGP
RSSRPSMDSE	GGSLLLDEDS	EVFKMLQENR	EGRAAPRQSS	SFRLLQEALE
AEERGGTPAF	LPSSLSPQSS	LPASRALATP	PKLHTCEKCS	TSIANQAVRI
QEGRYRHPGC	YTCADCGLNL	KMRGHFWVGD	ELYCEKHARQ	RYSAPATLSS
RA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13992 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96JY6 (англ.) . Архів оригіналу за 26 листопада 2017. Процитовано 7 вересня 2017.