PIWIL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2L5C, 2L5D, 3O3I, 3O6E, 3O7V

Ідентифікатори

Символи

PIWIL1, CT80.1, HIWI, MIWI, PIWI, piwi like RNA-mediated gene silencing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605571 MGI: 1928897 HomoloGene: 37963 GeneCards: PIWIL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase binding • RNA binding • single-stranded RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • endoribonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • piRNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • polysome binding • mRNA cap binding complex binding
Клітинна компонента	• Полісома • клітинне ядро • mRNA cap binding complex • dense body • P granule • цитоплазма • chromatoid body
Біологічний процес	• multicellular organism development • regulation of translation • GO:0007126 мейоз • диференціація клітин • Сайленсинг генів • Сперматогенез • negative regulation of transposition • piRNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • spermatid development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9271


57749

Ensembl


ENSG00000275051 ENSG00000125207


ENSMUSG00000029423

UniProt


Q96J94


Q9JMB7

RefSeq (мРНК)


NM_001190971 NM_004764


NM_021311

RefSeq (білок)


NP_001177900 NP_004755


NP_067286

Локус (UCSC)

Хр. 12: 130.34 – 130.37 Mb

Хр. 5: 128.78 – 128.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PIWIL1 (англ. Piwi like RNA-mediated gene silencing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 861 амінокислот, а молекулярна маса — 98 603^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTGRARARAR	GRARGQETAQ	LVGSTASQQP	GYIQPRPQPP	PAEGELFGRG
RQRGTAGGTA	KSQGLQISAG	FQELSLAERG	GRRRDFHDLG	VNTRQNLDHV
KESKTGSSGI	IVRLSTNHFR	LTSRPQWALY	QYHIDYNPLM	EARRLRSALL
FQHEDLIGKC	HAFDGTILFL	PKRLQQKVTE	VFSKTRNGED	VRITITLTNE
LPPTSPTCLQ	FYNIIFRRLL	KIMNLQQIGR	NYYNPNDPID	IPSHRLVIWP
GFTTSILQYE	NSIMLCTDVS	HKVLRSETVL	DFMFNFYHQT	EEHKFQEQVS
KELIGLVVLT	KYNNKTYRVD	DIDWDQNPKS	TFKKADGSEV	SFLEYYRKQY
NQEITDLKQP	VLVSQPKRRR	GPGGTLPGPA	MLIPELCYLT	GLTDKMRNDF
NVMKDLAVHT	RLTPEQRQRE	VGRLIDYIHK	NDNVQRELRD	WGLSFDSNLL
SFSGRILQTE	KIHQGGKTFD	YNPQFADWSK	ETRGAPLISV	KPLDNWLLIY
TRRNYEAANS	LIQNLFKVTP	AMGMQMRKAI	MIEVDDRTEA	YLRVLQQKVT
ADTQIVVCLL	SSNRKDKYDA	IKKYLCTDCP	TPSQCVVART	LGKQQTVMAI
ATKIALQMNC	KMGGELWRVD	IPLKLVMIVG	IDCYHDMTAG	RRSIAGFVAS
INEGMTRWFS	RCIFQDRGQE	LVDGLKVCLQ	AALRAWNSCN	EYMPSRIIVY
RDGVGDGQLK	TLVNYEVPQF	LDCLKSIGRG	YNPRLTVIVV	KKRVNTRFFA
QSGGRLQNPL	PGTVIDVEVT	RPEWYDFFIV	SQAVRSGSVS	PTHYNVIYDN
SGLKPDHIQR	LTYKLCHIYY	NWPGVIRVPA	PCQYAHKLAF	LVGQSIHREP
NLSLSNRLYY	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Qiao D., Zeeman A.-M., Deng W., Looijenga L.H.J., Lin H. (2002). Molecular characterization of hiwi, a human member of the piwi gene family whose overexpression is correlated to seminomas. Oncogene. 21: 3988—3999. PMID 12037681 DOI:10.1038/sj.onc.1205505
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sasaki T., Shiohama A., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome. Genomics. 82: 323—330. PMID 12906857 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00129-0
Tian Y., Simanshu D.K., Ma J.B., Patel D.J. (2011). Structural basis for piRNA 2'-O-methylated 3'-end recognition by Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille) domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 903—910. PMID 21193640 DOI:10.1073/pnas.1017762108
Zeng L., Zhang Q., Yan K., Zhou M.M. (2011). Structural insights into piRNA recognition by the human PIWI-like 1 PAZ domain. Proteins. 79: 2004—2009. PMID 21465557 DOI:10.1002/prot.23003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9007 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96J94 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.