SSBP2

Ідентифікатори

Символи

SSBP2, HSPC116, SOSS-B2, single stranded DNA binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607389 MGI: 1914220 HomoloGene: 22724 GeneCards: SSBP2

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23635


66970

Ensembl


ENSG00000145687


ENSMUSG00000003992

UniProt


P81877


Q9CYZ8

RefSeq (мРНК)

NM_001256732 NM_001256733 NM_001256734 NM_001256735 NM_001256736
NM_012446 NM_001345886 NM_001394350 NM_001394351 NM_001394352


NM_024186 NM_024272 NM_001360775 NM_001360776

RefSeq (білок)

NP_001243661 NP_001243662 NP_001243663 NP_001243664 NP_001243665
NP_001332815 NP_036578


NP_077148 NP_077234 NP_001347704 NP_001347705

Локус (UCSC)

Хр. 5: 81.41 – 81.75 Mb

Хр. 13: 91.46 – 91.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SSBP2 (англ. Single stranded DNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 37 828^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYGKGKSNSS	AVPSDSQARE	KLALYVYEYL	LHVGAQKSAQ	TFLSEIRWEK
NITLGEPPGF	LHSWWCVFWD	LYCAAPERRE	TCEHSSEAKA	FHDYSAAAAP
SPVLGNIPPG	DGMPVGPVPP	GFFQPFMSPR	YPGGPRPPLR	IPNQALGGVP
GSQPLLPSGM	DPTRQQGHPN	MGGPMQRMTP	PRGMVPLGPQ	NYGGAMRPPL
NALGGPGMPG	MNMGPGGGRP	WPNPTNANSI	PYSSASPGNY	VGPPGGGGPP
GTPIMPSPAD	STNSGDNMYT	LMNAVPPGPN	RPNFPMGPGS	DGPMGGLGGM
ESHHMNGSLG	SGDMDSISKN	SPNNMSLSNQ	PGTPRDDGEM	GGNFLNPFQS
ESYSPSMTMS	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SSBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15831 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, P81877 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 5 вересня 2017.