ZC3H13

Ідентифікатори

Символи

ZC3H13, KIAA0853, zinc finger CCCH-type containing 13, Xio

Зовнішні ІД

OMIM: 616453 MGI: 1914552 GeneCards: ZC3H13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding
Клітинна компонента	• nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex
Біологічний процес	• mRNA processing • multicellular organism development • Сплайсинг РНК • mRNA methylation • regulation of stem cell population maintenance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23091


67302

Ensembl


ENSG00000123200


ENSMUSG00000022000

UniProt


Q5T200


E9Q784

RefSeq (мРНК)

NM_015070 NM_001076788 NM_001330564 NM_001330565 NM_001330566
NM_001330567 NM_001382206 NM_001382207 NM_001382208 NM_001382209 NM_001382210 NM_001382211 NM_001382212 NM_001382213 NM_001382214


NM_026083 NM_027377 NM_001359875

RefSeq (білок)

NP_001070256 NP_001317493 NP_001317494 NP_001317495 NP_001317496
NP_055885 NP_001369135 NP_001369136 NP_001369137 NP_001369138 NP_001369139 NP_001369140 NP_001369141 NP_001369142 NP_001369143


NP_080359 NP_001346804

Локус (UCSC)

Хр. 13: 45.95 – 46.05 Mb

Хр. 14: 75.52 – 75.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZC3H13 (англ. Zinc finger CCCH-type containing 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 668 амінокислот, а молекулярна маса — 196 635^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKIRRKVTV	ENTKTISDST	SRRPSVFERL	GPSTGSTAET	QCRNWLKTGN
CLYGNTCRFV	HGPSPRGKGY	SSNYRRSPER	PTGDLRERMK	NKRQDVDTEP
QKRNTEESSS	PVRKESSRGR	HREKEDIKIT	KERTPESEEE	NVEWETNRDD
SDNGDINYDY	VHELSLEMKR	QKIQRELMKL	EQENMEKREE	IIIKKEVSPE
VVRSKLSPSP	SLRKSSKSPK	RKSSPKSSSA	SKKDRKTSAV	SSPLLDQQRN
SKTNQSKKKG	PRTPSPPPPI	PEDIALGKKY	KEKYKVKDRI	EEKTRDGKDR
GRDFERQREK	RDKPRSTSPA	GQHHSPISSR	HHSSSSQSGS	SIQRHSPSPR
RKRTPSPSYQ	RTLTPPLRRS	ASPYPSHSLS	SPQRKQSPPR	HRSPMREKGR
HDHERTSQSH	DRRHERREDT	RGKRDREKDS	REEREYEQDQ	SSSRDHRDDR
EPRDGRDRRD	ARDTRDRREL	RDSRDMRDSR	EMRDYSRDTK	ESRDPRDSRS
TRDAHDYRDR	EGRDTHRKED	TYPEESRSYG	RNHLREESSR	TEIRNESRNE
SRSEIRNDRM	GRSRGRVPEL	PEKGSRGSRG	SQIDSHSSNS	NYHDSWETRS
SYPERDRYPE	RDNRDQARDS	SFERRHGERD	RRDNRERDQR	PSSPIRHQGR
NDELERDERR	EERRVDRVDD	RRDERARERD	RERERDRERE	RERERERDRE
REKERELERE	RARERERERE	KERDRERDRD	RDHDRERERE	RERDREKERE
REREERERER	ERERERERER	ERERERARER	DKERERQRDW	EDKDKGRDDR
REKREEIRED	RNPRDGHDER	KSKKRYRNEG	SPSPRQSPKR	RREHSPDSDA
YNSGDDKNEK	HRLLSQVVRP	QESRSLSPSH	LTEDRQGRWK	EEDRKPERKE
SSRRYEEQEL	KEKVSSVDKQ	REQTEILESS	RMRAQDIIGH	HQSEDRETSD
RAHDENKKKA	KIQKKPIKKK	KEDDVGIERG	NIETTSEDGQ	VFSPKKGQKK
KSIEKKRKKS	KGDSDISDEE	AAQQSKKKRG	PRTPPITTKE	ELVEMCNGKN
GILEDSQKKE	DTAFSDWSDE	DVPDRTEVTE	AEHTATATTP	GSTPSPLSSL
LPPPPPVATA	TATTVPATLA	ATTAAAATSF	STSAITISTS	ATPTNTTNNT
FANEDSHRKC	HRTRVEKVET	PHVTIEDAQH	RKPMDQKRSS	SLGSNRSNRS
HTSGRLRSPS	NDSAHRSGDD	QSGRKRVLHS	GSRDREKTKS	LEITGERKSR
IDQLKRGEPS	RSTSSDRQDS	RSHSSRRSSP	ESDRQVHSRS	GSFDSRDRLQ
ERDRYEHDRE	RERERRDTRQ	REWDRDADKD	WPRNRDRDRL	RERERERERD
KRRDLDRERE	RLISDSVERD	RDRDRDRTFE	SSQIESVKRC	EAKLEGEHER
DLESTSRDSL	ALDKERMDKD	LGSVQGFEET	NKSERTESLE	GDDESKLDDA
HSLGSGAGEG	YEPISDDELD	EILAGDAEKR	EDQQDEEKMP	DPLDVIDVDW
SGLMPKHPKE	PREPGAALLK	FTPGAVMLRV	GISKKLAGSE	LFAKVKETCQ
RLLEKPKDAD	NLFEHELGAL	NMAALLRKEE	RASLLSNLGP	CCKALCFRRD
SAIRKQLVKN	EKGTIKQAYT	SAPMVDNELL	RLSLRLFKRK	TTCHAPGHEK
TEDNKLSQSS	IQQELCVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20368 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5T200 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2018. Процитовано 11 вересня 2017.