ZKSCAN1

Ідентифікатори

Символи

ZKSCAN1, 9130423L19Rik, KOX18, PHZ-37, ZNF139, ZNF36, ZSCAN33, zinc finger with KRAB and SCAN domains 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601260 MGI: 1921820 HomoloGene: 34523 GeneCards: ZKSCAN1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7586


74570

Ensembl


ENSG00000106261


ENSMUSG00000029729

UniProt


P17029


Q8BGS3

RefSeq (мРНК)

NM_001287054 NM_001287055 NM_003439 NM_001346579 NM_001346580
NM_001346581


NM_029869 NM_133906

RefSeq (білок)

NP_001273983 NP_001273984 NP_001333508 NP_001333509 NP_001333510
NP_003430


NP_084145 NP_598667

Локус (UCSC)

Хр. 7: 100.02 – 100.04 Mb

Хр. 5: 138.08 – 138.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZKSCAN1 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 63 630^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMTAESREAT	GLSPQAAQEK	DGIVIVKVEE	EDEEDHMWGQ	DSTLQDTPPP
DPEIFRQRFR	RFCYQNTFGP	REALSRLKEL	CHQWLRPEIN	TKEQILELLV
LEQFLSILPK	ELQVWLQEYR	PDSGEEAVTL	LEDLELDLSG	QQVPGQVHGP
EMLARGMVPL	DPVQESSSFD	LHHEATQSHF	KHSSRKPRLL	QSRALPAAHI
PAPPHEGSPR	DQAMASALFT	ADSQAMVKIE	DMAVSLILEE	WGCQNLARRN
LSRDNRQENY	GSAFPQGGEN	RNENEESTSK	AETSEDSASR	GETTGRSQKE
FGEKRDQEGK	TGERQQKNPE	EKTRKEKRDS	GPAIGKDKKT	ITGERGPREK
GKGLGRSFSL	SSNFTTPEEV	PTGTKSHRCD	ECGKCFTRSS	SLIRHKIIHT
GEKPYECSEC	GKAFSLNSNL	VLHQRIHTGE	KPHECNECGK	AFSHSSNLIL
HQRIHSGEKP	YECNECGKAF	SQSSDLTKHQ	RIHTGEKPYE	CSECGKAFNR
NSYLILHRRI	HTREKPYKCT	KCGKAFTRSS	TLTLHHRIHA	RERASEYSPA
SLDAFGAFLK	SCV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders. Genomics. 27: 259—264. PMID 7557990 DOI:10.1006/geno.1995.1040
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol. 2: 363—374. PMID 2288909

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13101 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P17029 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.