LIM结构域

LIM domain
Pinch蛋白的第四个LIM结构域,锌原子为灰色
鑑定
標誌LIM
PfamPF00412(旧版)
InterPro英语InterProIPR001781
PROSITE英语PROSITEPDOC50178
SCOP英语Structural Classification of Proteins1ctl / SUPFAM
CDD英语Conserved Domain Databasecd08368
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要
PDB1ctlA:11–67

LIM结构域(英語:LIM domain)是一种蛋白质结构域,由两个疏水氨基酸残基连接两个锌指结构组成[1],其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母[2]。LIM结构域介导蛋白質交互作用,参与细胞骨架组建,在器官发育和肿瘤发生中有重要作用。

除了关键氨基酸如结合锌的半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM结构域的氨基酸序列高度可变,其通式如下:

[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]

LIM结构域的图示

参考文献

  1. ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499. 
  2. ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7. 
  • 3H英语3H domain
  • ABM英语ABM domain
  • ACDC英语ACDC domain
  • ACT英语ACT domain
  • ADF-H英语ADF-H domain
  • ANTH英语ANTH domain
  • ARID英语ARID domain
  • BAR
  • BEN英语BEN domain
  • BESS英语BESS domain
  • BIR英语Inhibitor of apoptosis domain
  • BMC英语BMC domain
  • BPS英语BPS domain
  • BTB/POZ英语BTB/POZ domain
  • BZIP英语BZIP domain
  • C1英语C1 domain
  • C2英语C2 domain
  • Cache英语Cache domain
  • CBS英语CBS domain
  • CGI-121英语Kinase binding protein CGI-121
  • CRM英语CRM domain
  • CUB英语CUB domain
  • CUT英语CUT domain
  • CVNH英语CVNH domain
  • 死亡英语Death fold
    • CARD英语CARD domain
    • DD英语Death domain
    • DED英语Death effector domain
    • Pyrin英语Pyrin domain
  • DEP
  • DHHC英语DHHC domain
  • DHR1英语DHR1 domain
  • DHR2英语DHR2 domain
  • DM英语DM domain
  • EcoEI_R_C英语EcoEI R protein C-terminal domain
  • EF1英语EF1 guanine nucleotide exchange domain
  • ENTH
  • FGGY英语FGGY carbohydrate kinase family
  • FYVE英语FYVE domain
  • HEAT英语HEAT repeat
  • Kringle英语Kringle domain
  • LIM
  • LRR
  • NACHT英语NACHT domain
  • PAS
    • LOV英语Light-oxygen-voltage-sensing domain
  • PDZ英语PDZ domain
  • PH
  • PX
  • SH2
  • SH3
  • SUN
  • TRIO英语CRAL-TRIO domain
  • WD40英语WD40 repeat
  • X8
  • YTH英语YTH protein domain
  • 锌指