Polimeraza

Struktura Taq DNK polimeraze

Polimeraza (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) je enzim čija centralna funkcije je formiranje polimera nukleinskih kiselina kao što su RNK i DNK.[1] Reakcija polimerizacije nove DNK ili RNK se izvodi koristeći postojeći DNK ili RNK templet u procesima replikacije i transkripcije. U sprezi sa klasterom drugih enzima i proteina, polimeraza koristi nukleotide iz rastvora, i katalizuje sintezu polinukleotidne sekvence sledeći lanac nukleotidnog templeta.[2]

Vidi još

  • DNK polimeraza
  • RNK polimeraza
    • RNK polimeraza I
    • RNK polimeraza II
    • RNK polimeraza III
    • T7 RNK polimeraza
  • p
  • r
  • u
Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)
2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH- akceptor
2.7.2: COOH akceptor
2.7.3: N akceptor
2.7.4: PO4 akceptor
2.7.6: difosfotransferaze
(P2O7)2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO4-nukleozid)
Polimeraza
RNK nukleotidiltransferaza
Druge
2.7.8: razno
Fosfatidiltransferaze
Glikozil-1-fosfotransferaza
2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO4; proteinski akceptor)
vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost
vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Separacija
i inicijacija
Prokariotska
(inicijacija)
Eukariotska
(priprema u
G1 fazi)
Oba
Replikacija
Prokariotska
(elongacija)
Eukariotska
(sinteza u
S fazi)
Oba
Kretanje: Procesivnost  DNK ligaza
Terminacija
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr)  tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts)  tltn (risu, pttl, nexn)  dnab, rnab/runp  stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
  • p
  • r
  • u
Teme
Tipovi
EC1 Oksidoreduktaze/spisak  • EC2 Transferaze/spisak  • EC3 Hidrolaze/spisak  • EC4 Lijaze/spisak  • EC5 Izomeraze/spisak  • EC6 Ligaze/spisak
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6

Reference

  1. Donald Voet, Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 izd.). Wiley. ISBN 978-0-471-19350-0. 
  2. Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter (2002). Molecular Biology of the Cell. New York: Garlard Science. ISBN 0-8153-3218-1. 

Literatura

  • Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X. 
  • Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.