CD1D

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4WO4, 1ZT4, 2PO6, 3HUJ, 3SDX, 3TZV, 3U0P, 3VWJ, 3VWK, 4EN3, 4LHU, 4MNG, 4MQ7, 4WW2

Ідентифікатори

Символи

CD1D, CD1A, R3, R3G1, CD1d molecule

Зовнішні ІД

OMIM: 188410 MGI: 107674 HomoloGene: 1337 GeneCards: CD1D

Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-2-microglobulin binding • ліпопептидний зв'язок • GO:0031493 histone binding • endogenous lipid antigen binding • lipid antigen binding • exogenous lipid antigen binding • cell adhesion molecule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • ендосома • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • lysosomal membrane • basolateral plasma membrane • лізосома • endosome membrane • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• процес імунної системи • T cell selection • heterotypic cell-cell adhesion • positive regulation of T cell proliferation • detection of bacterium • positive regulation of innate immune response • antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • antigen processing and presentation, endogenous lipid antigen via MHC class Ib • regulation of immune response • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


912


12479

Ensembl


ENSG00000158473


ENSMUSG00000028076

UniProt


P15813


P11609

RefSeq (мРНК)


NM_001766 NM_001319145 NM_001371761 NM_001371762 NM_001371763


NM_007639 NM_001379501 NM_001379502 NM_001379503

RefSeq (білок)


NP_001306074 NP_001757 NP_001358690 NP_001358691 NP_001358692


NP_031665 NP_001366430 NP_001366431 NP_001366432

Локус (UCSC)

Хр. 1: 158.18 – 158.19 Mb

Хр. 3: 86.9 – 86.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CD1D (англ. CD1d molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 717^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCLLFLLLW	ALLQAWGSAE	VPQRLFPLRC	LQISSFANSS	WTRTDGLAWL
GELQTHSWSN	DSDTVRSLKP	WSQGTFSDQQ	WETLQHIFRV	YRSSFTRDVK
EFAKMLRLSY	PLELQVSAGC	EVHPGNASNN	FFHVAFQGKD	ILSFQGTSWE
PTQEAPLWVN	LAIQVLNQDK	WTRETVQWLL	NGTCPQFVSG	LLESGKSELK
KQVKPKAWLS	RGPSPGPGRL	LLVCHVSGFY	PKPVWVKWMR	GEQEQQGTQP
GDILPNADET	WYLRATLDVV	AGEAAGLSCR	VKHSSLEGQD	IVLYWGGSYT
SMGLIALAVL	ACLLFLLIVG	FTSRFKRQTS	YQGVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, ендосомах.

Література

Calabi F., Jarvis J.M., Martin L., Milstein C. (1989). Two classes of CD1 genes. Eur. J. Immunol. 19: 285—292. PMID 2467814 DOI:10.1002/eji.1830190211
Balk S.P., Bleicher P.A., Terhorst C. (1989). Isolation and characterization of a cDNA and gene coding for a fourth CD1 molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 252—256. PMID 2463622 DOI:10.1073/pnas.86.1.252
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Han M., Hannick L.I., DiBrino M., Robinson M.A. (1999). Polymorphism of human CD1 genes. Tissue Antigens. 54: 122—127. PMID 10488738 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540202.x
Martin L.H., Calabi F., Milstein C. (1986). Isolation of CD1 genes: a family of major histocompatibility complex-related differentiation antigens. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9154—9158. PMID 3097645 DOI:10.1073/pnas.83.23.9154
Kang S.-J., Cresswell P. (2002). Regulation of intracellular trafficking of human CD1d by association with MHC class II molecules. EMBO J. 21: 1650—1660. PMID 11927549 DOI:10.1093/emboj/21.7.1650

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1637 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P15813 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350