LAMP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MOF, 2MOM

Ідентифікатори

Символи

LAMP2, CD107b, LAMP-2, LAMPB, LGP110, lysosomal associated membrane protein 2, LGP-96, DND

Зовнішні ІД

OMIM: 309060 MGI: 96748 HomoloGene: 7809 GeneCards: LAMP2

Пов'язані генетичні захворювання

Danon disease^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • membrane microdomain • ендосома • late endosome • phagocytic vesicle membrane • chaperone-mediated autophagy translocation complex • мембрана • late endosome membrane • клітинна мембрана • lysosomal membrane • lysosomal lumen • platelet dense granule membrane • лізосома • endosome membrane • екзосома • autophagosome membrane • міжклітинний простір • trans-Golgi network • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • azurophil granule membrane • autolysosome • perinuclear region of cytoplasm • integral component of autophagosome membrane • ficolin-1-rich granule membrane • membrane raft • lysosomal matrix
Біологічний процес	• regulation of protein stability • muscle cell cellular homeostasis • protein stabilization • platelet degranulation • protein import • сортування білків • автофагія • cellular response to starvation • negative regulation of protein homooligomerization • neutrophil degranulation • chaperone-mediated autophagy • protein targeting to lysosome involved in chaperone-mediated autophagy • GO:0000046 autophagosome maturation • lysosomal protein catabolic process • establishment of protein localization to organelle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3920


16784

Ensembl


ENSG00000005893


ENSMUSG00000016534

UniProt


P13473


P17047

RefSeq (мРНК)


NM_013995 NM_001122606 NM_002294


NM_001017959 NM_001290485 NM_010685

RefSeq (білок)


NP_001116078 NP_002285 NP_054701


NP_001017959 NP_001277414 NP_034815

Локус (UCSC)

Хр. X: 120.43 – 120.47 Mb

Хр. X: 37.49 – 37.55 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LAMP2 (англ. Lysosomal associated membrane protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 44 961^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCFRLFPVP	GSGLVLVCLV	LGAVRSYALE	LNLTDSENAT	CLYAKWQMNF
TVRYETTNKT	YKTVTISDHG	TVTYNGSICG	DDQNGPKIAV	QFGPGFSWIA
NFTKAASTYS	IDSVSFSYNT	GDNTTFPDAE	DKGILTVDEL	LAIRIPLNDL
FRCNSLSTLE	KNDVVQHYWD	VLVQAFVQNG	TVSTNEFLCD	KDKTSTVAPT
IHTTVPSPTT	TPTPKEKPEA	GTYSVNNGND	TCLLATMGLQ	LNITQDKVAS
VININPNTTH	STGSCRSHTA	LLRLNSSTIK	YLDFVFAVKN	ENRFYLKEVN
ISMYLVNGSV	FSIANNNLSY	WDAPLGSSYM	CNKEQTVSVS	GAFQINTFDL
RVQPFNVTQG	KYSTAQDCSA	DDDNFLVPIA	VGAALAGVLI	LVLLAYFIGL
KHHHAGYEQF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

Konecki D.S., Foetisch K., Schlotter M., Lichter-Konecki U. (1994). Complete cDNA sequence of human lysosome-associated membrane protein-2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1—5. PMID 7999007 DOI:10.1006/bbrc.1994.2620
Konecki D.S., Foetisch K., Zimmer K.P., Schlotter M., Lichter-Konecki U. (1995). An alternatively spliced form of the human lysosome-associated membrane protein-2 gene is expressed in a tissue-specific manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 757—767. PMID 7488019 DOI:10.1006/bbrc.1995.2528
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Carlsson S.R., Lycksell P.-O., Fukuda M. (1993). Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. Arch. Biochem. Biophys. 304: 65—73. PMID 8323299 DOI:10.1006/abbi.1993.1322
Cuervo A.M., Dice J.F. (1996). A receptor for the selective uptake and degradation of proteins by lysosomes. Science. 273: 501—503. PMID 8662539 DOI:10.1126/science.273.5274.501

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6501 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P13473 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350