BATF

BATF
Ідентифікатори
Символи BATF, B-ATF, BATF1, SFA-2, SFA2, basic leucine zipper ATF-like transcription factor
Зовнішні ІД OMIM: 612476 MGI: 1859147 HomoloGene: 4666 GeneCards: BATF
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
T-helper 2 cell differentiation
GO:0032617 cytokine production
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
myeloid dendritic cell differentiation
lymphoid progenitor cell differentiation
T-helper 17 cell lineage commitment
cellular response to DNA damage stimulus
hematopoietic stem cell differentiation
Перемикання класу імуноглобулінів
T-helper 17 cell differentiation
defense response to protozoan
cytokine-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10538
53314
Ensembl
ENSG00000156127
ENSMUSG00000034266
UniProt
Q16520
O35284
RefSeq (мРНК)
NM_006399
NM_016767
RefSeq (білок)
NP_006390
NP_058047
Локус (UCSC) Хр. 14: 75.52 – 75.55 Mb Хр. 12: 85.73 – 85.76 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BATF (англ. Basic leucine zipper ATF-like transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 125 амінокислот, а молекулярна маса — 14 120[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPHSSDSSDSSFSRSPPPGKQDSSDDVRRVQRREKNRIAAQKSRQRQTQK
ADTLHLESEDLEKQNAALRKEIKQLTEELKYFTSVLNSHEPLCSVLAAST
PSPPEVVYSAHAFHQPHVSSPRFQP

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wang X., Johansen L.M., Tae H.-J., Taparowsky E.J. (1996). IFP 35 forms complexes with B-ATF, a member of the AP1 family of transcription factors. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229: 316—322. PMID 8954125 DOI:10.1006/bbrc.1996.1799
  • Echlin D.R., Tae H.-J., Mitin N., Taparowsky E.J. (2000). B-ATF functions as a negative regulator of AP-1 mediated transcription and blocks cellular transformation by Ras and Fos. Oncogene. 19: 1752—1763. PMID 10777209 DOI:10.1038/sj.onc.1203491

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з BATF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:958 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, Q16520 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші