MMP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1CK7, 1CXW, 1EAK, 1GEN, 1GXD, 1HOV, 1J7M, 1KS0, 1QIB, 1RTG, 3AYU | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MMP2, CLG4, CLG4A, MMP-2, MMP-II, MONA, TBE-1, matrix metallopeptidase 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120360 MGI: 97009 HomoloGene: 3329 GeneCards: MMP2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
tiludronic acid[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • serine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • саркомера • extracellular region • мітохондрія • клітинне ядро • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • intramembranous ossification • response to hypoxia • endodermal cell differentiation • ephrin receptor signaling pathway • skeletal system morphogenesis • extracellular matrix disassembly • bone trabecula formation • протеоліз • Ангіогенез • positive regulation of innate immune response • collagen catabolic process • cellular response to amino acid stimulus • face morphogenesis • embryo implantation • blood vessel maturation • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • cytokine-mediated signaling pathway • extracellular matrix organization • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • tissue remodeling • response to amyloid-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004530 NM_001127891 NM_001302508 NM_001302509 NM_001302510 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001121363 NP_001289437 NP_001289438 NP_001289439 NP_004521 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 55.39 – 55.51 Mb | Хр. 8: 93.55 – 93.58 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MMP2 (англ. Matrix metallopeptidase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 73 882[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEALMARGAL | | TGPLRALCLL | | GCLLSHAAAA | | PSPIIKFPGD | | VAPKTDKELA |
VQYLNTFYGC | | PKESCNLFVL | | KDTLKKMQKF | | FGLPQTGDLD | | QNTIETMRKP |
RCGNPDVANY | | NFFPRKPKWD | | KNQITYRIIG | | YTPDLDPETV | | DDAFARAFQV |
WSDVTPLRFS | | RIHDGEADIM | | INFGRWEHGD | | GYPFDGKDGL | | LAHAFAPGTG |
VGGDSHFDDD | | ELWTLGEGQV | | VRVKYGNADG | | EYCKFPFLFN | | GKEYNSCTDT |
GRSDGFLWCS | | TTYNFEKDGK | | YGFCPHEALF | | TMGGNAEGQP | | CKFPFRFQGT |
SYDSCTTEGR | | TDGYRWCGTT | | EDYDRDKKYG | | FCPETAMSTV | | GGNSEGAPCV |
FPFTFLGNKY | | ESCTSAGRSD | | GKMWCATTAN | | YDDDRKWGFC | | PDQGYSLFLV |
AAHEFGHAMG | | LEHSQDPGAL | | MAPIYTYTKN | | FRLSQDDIKG | | IQELYGASPD |
IDLGTGPTPT | | LGPVTPEICK | | QDIVFDGIAQ | | IRGEIFFFKD | | RFIWRTVTPR |
DKPMGPLLVA | | TFWPELPEKI | | DAVYEAPQEE | | KAVFFAGNEY | | WIYSASTLER |
GYPKPLTSLG | | LPPDVQRVDA | | AFNWSKNKKT | | YIFAGDKFWR | | YNEVKKKMDP |
GFPKLIADAW | | NAIPDNLDAV | | VDLQGGGHSY | | FFKGAYYLKL | | ENQSLKSVKF |
GSIKSDWLGC |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Collier I.E., Bruns G.A.P., Goldberg G.I., Gerhard D.S. (1991). On the structure and chromosome location of the 72- and 92-kDa human type IV collagenase genes. Genomics. 9: 429—434. PMID 1851724 DOI:10.1016/0888-7543(91)90408-7
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Butler G.S., Will H., Atkinson S.J., Murphy G. (1997). Membrane-type-2 matrix metalloproteinase can initiate the processing of progelatinase A and is regulated by the tissue inhibitors of metalloproteinases. Eur. J. Biochem. 244: 653—657. PMID 9119036 DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00653.x
- Brooks P.C., Silletti S., von Schalscha T.L., Friedlander M., Cheresh D.A. (1998). Disruption of angiogenesis by PEX, a noncatalytic metalloproteinase fragment with integrin binding activity. Cell. 92: 391—400. PMID 9476898 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80931-9
- Fernandez-Patron C., Radomski M.W., Davidge S.T. (1999). Vascular matrix metalloproteinase-2 cleaves big endothelin-1 yielding a novel vasoconstrictor. Circ. Res. 85: 906—911. PMID 10559137 DOI:10.1161/01.RES.85.10.906
- Chattopadhyay N., Mitra A., Frei E., Chatterjee A. (2001). Human cervical tumor cell (SiHa) surface alphavbeta3 integrin receptor has associated matrix metalloproteinase (MMP-2) activity. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 127: 653—658. PMID 11710594 DOI:10.1007/s004320100271
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з matrix metallopeptidase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7166 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P08253 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24) |
---|
| Білки ADAM | |
---|
| Матриксні металопротеїнази | |
---|
|
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |