MMP9

MMP9
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1GKC, 1GKD, 1ITV, 1L6J, 2OVX, 2OVZ, 2OW0, 2OW1, 2OW2, 4H1Q, 4H2E, 4H3X, 4H82, 4HMA, 4JIJ, 4JQG, 4WZV, 4XCT, 5CUH, 5I12

Ідентифікатори
Символи MMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9
Зовнішні ІД OMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9
Реагує на сполуку
cts-1027[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• collagen binding
• zinc ion binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• endopeptidase activity
• serine-type endopeptidase activity
• metalloendopeptidase activity

Клітинна компонента

• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• екзосома
• міжклітинний простір
• tertiary granule lumen
• ficolin-1-rich granule lumen
• extracellular region
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• skeletal system development
• negative regulation of cation channel activity
• positive regulation of protein phosphorylation
• endodermal cell differentiation
• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway
• осифікація
• negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
• ephrin receptor signaling pathway
• extracellular matrix disassembly
• negative regulation of apoptotic process
• протеоліз
• macrophage differentiation
• positive regulation of keratinocyte migration
• positive regulation of apoptotic process
• collagen catabolic process
• positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
• positive regulation of receptor binding
• positive regulation of DNA binding
• positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
• embryo implantation
• leukocyte migration
• positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
• extracellular matrix organization
• positive regulation of cell migration
• neutrophil degranulation
• GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species
• cellular response to cadmium ion
• cytokine-mediated signaling pathway
• regulation of neuroinflammatory response
• negative regulation of epithelial cell differentiation involved in kidney development
• response to amyloid-beta

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4318
17395
Ensembl
ENSG00000100985
ENSMUSG00000017737
UniProt
P14780
P41245
RefSeq (мРНК)
NM_004994
NM_013599
RefSeq (білок)
NP_004985
NP_038627
Локус (UCSC) Хр. 20: 46.01 – 46.02 Mb Хр. 2: 164.78 – 164.8 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP9 (англ. Matrix metallopeptidase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 458[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLY
RYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCG
VPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSA
VTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQG
DAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRS
DGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFP
FTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAA
HEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPE
PRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAG
PSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRP
QGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEV
DRMFPGVPLDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYD
ILQCPED

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sang Q.X., Birkedal-Hansen H., Van Wart H.E. (1995). Proteolytic and non-proteolytic activation of human neutrophil progelatinase B. Biochim. Biophys. Acta. 1251: 99—108. PMID 7669817 DOI:10.1016/0167-4838(95)00086-A
  • Masure S., Proost P., van Damme J., Opdenakker G. (1991). Purification and identification of 91-kDa neutrophil gelatinase. Release by the activating peptide interleukin-8. Eur. J. Biochem. 198: 391—398. PMID 1645657 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16027.x
  • Cha H., Kopetzki E., Huber R., Lanzendoerfer M., Brandstetter H. (2002). Structural basis of the adaptive molecular recognition by MMP9. J. Mol. Biol. 320: 1065—1079. PMID 12126625 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00558-2
  • Sato H., Seiki M. (1993). Regulatory mechanism of 92 kDa type IV collagenase gene expression which is associated with invasiveness of tumor cells. Oncogene. 8: 395—405. PMID 8426746
  • Ogata Y., Enghild J.J., Nagase H. (1992). Matrix metalloproteinase 3 (stromelysin) activates the precursor for the human matrix metalloproteinase 9. J. Biol. Chem. 267: 3581—3584. PMID 1371271

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7176 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P14780 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.