MMP8

MMP8
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1A86, 1JAP, 1I76, 1ZVX, 3TT4, 2OY2, 1ZS0, 1JAN, 1MMB, 1I73, 1A85, 1KBC, 1ZP5, 1JH1, 3DPF, 1JAQ, 3DPE, 1BZS, 4QKZ, 1JAO, 3DNG, 2OY4, 1MNC

Ідентифікатори
Символи MMP8, CLG1, HNC, MMP-8, PMNL-CL, matrix metallopeptidase 8
Зовнішні ІД OMIM: 120355 MGI: 1202395 HomoloGene: 22482 GeneCards: MMP8
Реагує на сполуку
cts-1027[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• zinc ion binding
• GO:0070122 peptidase activity
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• зв'язування з іоном металу
• serine-type endopeptidase activity
• metalloendopeptidase activity
• endopeptidase activity

Клітинна компонента

• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• extracellular region
• specific granule lumen
• tertiary granule lumen
• міжклітинний простір
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• collagen catabolic process
• extracellular matrix disassembly
• endodermal cell differentiation
• протеоліз
• neutrophil degranulation
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• negative regulation of gene expression
• negative regulation of interleukin-10 production
• positive regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of DNA binding
• positive regulation of MAPK cascade
• positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
• positive regulation of JNK cascade
• regulation of neuroinflammatory response
• positive regulation of neuroinflammatory response
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process
• regulation of microglial cell activation
• positive regulation of microglial cell activation
• extracellular matrix organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4317
17394
Ensembl
ENSG00000118113
ENSMUSG00000005800
UniProt
P22894
O70138
RefSeq (мРНК)
NM_001304441
NM_001304442
NM_002424
NM_008611
RefSeq (білок)
NP_001291370
NP_001291371
NP_002415
NP_032637
Локус (UCSC) Хр. 11: 102.71 – 102.73 Mb Хр. 9: 7.56 – 7.57 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP8 (англ. Matrix metallopeptidase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 53 412[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVSSKEKNTKTVQDYLEKFYQLPSNQYQS
TRKNGTNVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFM
LTPGNPKWERTNLTYRIRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTR
ISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEE
TWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETSNYSLP
QDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKD
RYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYW
ALSGYDILQGYPKDISNYGFPSSVQAIDAAVFYRSKTYFFVNDQFWRYDN
QRQFMEPGYPKSISGAFPGIESKVDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQ
RVTRVARGNKWLNCRYG

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Knaeuper V., Kraemer S., Reinke H., Tschesche H. (1990). Characterization and activation of procollagenase from human polymorphonuclear leucocytes. N-terminal sequence determination of the proenzyme and various proteolytically activated forms. Eur. J. Biochem. 189: 295—300. PMID 2159879 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb15489.x
  • Blaeser J., Knaeuper V., Osthues A., Reinke H., Tschesche H. (1991). Mercurial activation of human polymorphonuclear leucocyte procollagenase. Eur. J. Biochem. 202: 1223—1230. PMID 1662606 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16494.x
  • Blaeser J., Triebel S., Reinke H., Tschesche H. (1992). Formation of a covalent Hg-Cys-bond during mercurial activation of PMNL procollagenase gives evidence of a cysteine-switch mechanism. FEBS Lett. 313: 59—61. PMID 1330697 DOI:10.1016/0014-5793(92)81184-N
  • Knaeuper V., Kraemer S., Reinke H., Tschesche H. (1990). Partial amino acid sequence of human PMN leukocyte procollagenase. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 371: 295—304. PMID 2169256
  • Knaeuper V., Kraemer S., Reinke H., Tschesche H. (1990). Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 371: 733—733. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 2169766

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з matrix metallopeptidase 8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7175 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P22894 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.


  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.