CPSF6

CPSF6
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

3P5T, 3P6Y, 3Q2S, 3Q2T, 4B4N, 4U0A, 4U0B, 4WYM

معرفات
أسماء بديلة CPSF6, CFIM, CFIM68, HPBRII-4, HPBRII-7, cleavage and polyadenylation specific factor 6, CFIM72
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 604979 MGI: MGI:1913948 HomoloGene: 134126 GeneCards: 11052
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• mRNA binding
• RNA binding
• ربط حمض نووي
• ribosomal large subunit binding
• exon-exon junction complex binding

مكونات خلوية

• paraspeckles
• غشاء
• نواة
• بلازم نووي
• nuclear speck
• mRNA cleavage factor complex
• perichromatin fibrils
• سيتوبلازم
• عامل متخصص بالقص وعديد الأدينيلات
• interchromatin granule
• ribonucleoprotein complex

عمليات حيوية

• mRNA polyadenylation
• mRNA processing
• protein tetramerization
• positive regulation of RNA export from nucleus
• protein heterotetramerization
• pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
• mRNA alternative polyadenylation
• messenger ribonucleoprotein complex assembly

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي


المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 11052 432508
Ensembl ENSG00000111605 ENSMUSG00000055531
يونيبروت

Q16630

Q6NVF9

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001300947، ‏NM_007007، ‏XM_005268588، ‏XM_047428132 XM_005268590، ‏NM_001300947، ‏NM_007007، ‏XM_005268588، ‏XM_047428132

‏XM_006513852، ‏XM_006513853، ‏XM_006513855، ‏NM_001310609، ‏XR_001779551، ‏XM_030245171، ‏XM_030245172، ‏XM_030245173، ‏XR_003948728، ‏XR_003948730، ‏XR_004936219، ‏XR_004936220، ‏XR_004936221، ‏XR_004936222 NM_001013391، ‏XM_006513852، ‏XM_006513853، ‏XM_006513855، ‏NM_001310609، ‏XR_001779551، ‏XM_030245171، ‏XM_030245172، ‏XM_030245173، ‏XR_003948728، ‏XR_003948730، ‏XR_004936219، ‏XR_004936220، ‏XR_004936221، ‏XR_004936222

RefSeq (بروتين)

‏NP_008938، ‏XP_005268645، ‏XP_005268647 NP_001287876، ‏NP_008938، ‏XP_005268645، ‏XP_005268647

‏NP_001297538، ‏XP_006513915، ‏XP_006513916، ‏XP_006513918، ‏XP_030101031، ‏XP_030101032، ‏XP_030101033 NP_001013409، ‏NP_001297538، ‏XP_006513915، ‏XP_006513916، ‏XP_006513918، ‏XP_030101031، ‏XP_030101032، ‏XP_030101033

الموقع (UCSC n/a Chr 10: 117.18 – 117.22 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

CPSF6‏ (Cleavage and polyadenylation specific factor 6) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين CPSF6 في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Cardinale S، Cisterna B، Bonetti P، Aringhieri C، Biggiogera M، Barabino SM (أبريل 2007). "Subnuclear localization and dynamics of the Pre-mRNA 3' end processing factor mammalian cleavage factor I 68-kDa subunit". Molecular Biology of the Cell. ج. 18 ع. 4: 1282–92. DOI:10.1091/mbc.E06-09-0846. PMC:1838998. PMID:17267687.
  2. ^ Rüegsegger U، Blank D، Keller W (يناير 1998). "Human pre-mRNA cleavage factor Im is related to spliceosomal SR proteins and can be reconstituted in vitro from recombinant subunits". Molecular Cell. ج. 1 ع. 2: 243–53. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80025-8. PMID:9659921.
  3. ^ "Entrez Gene: CPSF6 cleavage and polyadenylation specific factor 6, 68kDa". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

  • Maruyama K، Sugano S (يناير 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. ج. 138 ع. 1–2: 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID:8125298.
  • Rüegsegger U، Beyer K، Keller W (مارس 1996). "Purification and characterization of human cleavage factor Im involved in the 3' end processing of messenger RNA precursors". The Journal of Biological Chemistry. ج. 271 ع. 11: 6107–13. DOI:10.1074/jbc.271.11.6107. PMID:8626397.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Suzuki Y، Yoshitomo-Nakagawa K، Maruyama K، Suyama A، Sugano S (أكتوبر 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. ج. 200 ع. 1–2: 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID:9373149.
  • de Vries H، Rüegsegger U، Hübner W، Friedlein A، Langen H، Keller W (نوفمبر 2000). "Human pre-mRNA cleavage factor II(m) contains homologs of yeast proteins and bridges two other cleavage factors". The EMBO Journal. ج. 19 ع. 21: 5895–904. DOI:10.1093/emboj/19.21.5895. PMC:305781. PMID:11060040.
  • Awasthi S، Alwine JC (نوفمبر 2003). "Association of polyadenylation cleavage factor I with U1 snRNP". RNA. ج. 9 ع. 11: 1400–9. DOI:10.1261/rna.5104603. PMC:1287061. PMID:14561889.
  • Brown KM، Gilmartin GM (ديسمبر 2003). "A mechanism for the regulation of pre-mRNA 3' processing by human cleavage factor Im". Molecular Cell. ج. 12 ع. 6: 1467–76. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00453-2. PMID:14690600.
  • Dettwiler S، Aringhieri C، Cardinale S، Keller W، Barabino SM (أغسطس 2004). "Distinct sequence motifs within the 68-kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding, protein-protein interactions, and subcellular localization". The Journal of Biological Chemistry. ج. 279 ع. 34: 35788–97. DOI:10.1074/jbc.M403927200. PMID:15169763.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Venkataraman K، Brown KM، Gilmartin GM (يونيو 2005). "Analysis of a noncanonical poly(A) site reveals a tripartite mechanism for vertebrate poly(A) site recognition". Genes & Development. ج. 19 ع. 11: 1315–27. DOI:10.1101/gad.1298605. PMC:1142555. PMID:15937220.
  • Rual JF، Venkatesan K، Hao T، Hirozane-Kishikawa T، Dricot A، Li N، Berriz GF، Gibbons FD، Dreze M، Ayivi-Guedehoussou N، Klitgord N، Simon C، Boxem M، Milstein S، Rosenberg J، Goldberg DS، Zhang LV، Wong SL، Franklin G، Li S، Albala JS، Lim J، Fraughton C، Llamosas E، Cevik S، Bex C، Lamesch P، Sikorski RS، Vandenhaute J، Zoghbi HY، Smolyar A، Bosak S، Sequerra R، Doucette-Stamm L، Cusick ME، Hill DE، Roth FP، Vidal M (أكتوبر 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514.
  • Millevoi S، Loulergue C، Dettwiler S، Karaa SZ، Keller W، Antoniou M، Vagner S (أكتوبر 2006). "An interaction between U2AF 65 and CF I(m) links the splicing and 3' end processing machineries". The EMBO Journal. ج. 25 ع. 20: 4854–64. DOI:10.1038/sj.emboj.7601331. PMC:1618107. PMID:17024186.
  • Ewing RM، Chu P، Elisma F، Li H، Taylor P، Climie S، McBroom-Cerajewski L، Robinson MD، O'Connor L، Li M، Taylor R، Dharsee M، Ho Y، Heilbut A، Moore L، Zhang S، Ornatsky O، Bukhman YV، Ethier M، Sheng Y، Vasilescu J، Abu-Farha M، Lambert JP، Duewel HS، Stewart II، Kuehl B، Hogue K، Colwill K، Gladwish K، Muskat B، Kinach R، Adams SL، Moran MF، Morin GB، Topaloglou T، Figeys D (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. ج. 3 ع. 1: 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC:1847948. PMID:17353931.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 12
جينات الكروموسوم 12
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 12 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية